يُعد القطار الخيار الأفضل للسفر إلى محافظات الصعيد نظرًا لراحته في المسافات الطويلة، خاصة على خط القاهرة – أسوان. وتستعرض الهيئة مواعيد القطارات المكيفة والقطارات الروسية، والتي تتطلب الحجز المسبق قبل السفر. أولاً: قطارات القاهرة – أسوان قطار 1902 (مكيف) يقوم 00:20 بعد منتصف الليل. قطار 980 (VIP) يقوم 08:00 صباحًا. قطار 2010 (مكيف) يقوم 10:00 صباحًا. قطار 982 (VIP) يقوم 12:00 ظهرًا. قطار 986 (مكيف) يقوم 14:00 عصرًا. قطار 2014 (VIP) يقوم 21:00 مساءً. قطار 976 (VIP) يقوم 20:00 مساءً. قطار 2030 (تالجو) يقوم 19:00 مساءً. قطار 84 و82 (نوم) مواعيدهما 19:20 و21:10 مساءً. ثانيًا: قطارات أسوان – القاهرة قطار 2011 (VIP) يقوم 05:15 صباحًا ويصل 18:00. قطار 981 (VIP) يقوم 05:30 صباحًا ويصل 19:35. قطار 983 (VIP) يقوم 07:30 صباحًا ويصل 21:40. قطار 2007 (VIP) يقوم 15:15 عصرًا. قطار 2015 (إسباني مطور) يقوم 16:00 عصرًا. قطار 997 (VIP) يقوم 20:45 مساءً. قطار 2031 (تالجو) يقوم 19:00 مساءً. قطار 83 و87 و85 (نوم) مواعيدها بين 16:20 و20:20. ثالثًا: خط الإسكندرية – أسوان (والعكس) قطار 88 (مكيف) يقوم من الإسكندرية 17:00 مساءً. قطار 934 (VIP) الإسكندرية – الأقصر 13:10 ظهرًا. قطار 2008 (VIP) الإسكندرية – أسوان 20:00 مساءً. قطار 935 (VIP) الأقصر – الإسكندرية 22:40 مساءً. قطار 86 (نوم) القاهرة – أسوان 19:45 مساءً. رابعًا: خط القاهرة – طنطا – المنصورة قطار 948 (سياحي) المنصورة – القاهرة 05:35 صباحًا. قطار 1915 (سياحي) شبرا الخيمة – المنصورة 15:35 عصرًا. قطار 1914 (سياحي) المنصورة – شبرا الخيمة 06:35 صباحًا.
